链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/cytoscape2.html
有向网络图
有向网络图与权重网络图类似。相比之下,有向网络图更关心基因调控方向,可通过线段方向展示基因间是促进或抑制、及作用的方向;
有向网络图工具仅需要按说明及示例文件整理数据文件即可出图了,并且进行后期调整了,非常方便。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/cytoscape.html
权重网络图及有向网络图的数据要求可以详见工具说明,我们以往也有相关教程及注意事项:
《网络图绘制太方便啦!可自由调整配色、形状! 》
kegg高级网络图
kegg网络图常用以表示通路间的相互作用关系。通过kegg网络图可寻找核心通路、或补充中断的通路,更便于用户从全局了解通路的关系、了解通路与基因的关系。
kegg网络图工具,需要提交相关通路文件进行绘图。得出初始结果后,可进行多种样式的调整,以及补充链接通路或相邻通路等:
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/kegg_senior_network.html
如果在OmicShare Tools中使用kegg富集分析进行分析及可视化,则在项目总览-预览中也能找到kegg高级网络图!kegg网络图详细教程可戳:
《网络图呈现通路间、通路与基因的关系,我看看谁还不会~》
详细动态调整方法:
《拿捏通路间关系可视化,kegg网络图轻松画!》
网络韦恩图
在数据分析中,常会使用韦恩图展示不同样本间共有或特有的元素及数量。而网络韦恩图,则是网络图和韦恩图结合而成的新可视化方式。
动态网络韦恩图工具适用性广,通过大、小节点及其间的连线,对特有或共有的性质进行展示。如下图,图中较大的节点(node)为分组名称,小的节点为组内的元素:
网络韦恩图(6组分组)
如何利用网络韦恩图工具绘制,可以参考工具说明及示例文件,或详见下方教程:
《如何绘制好看的“网络”韦恩图?》
网络韦恩图工具,可个性化的地方也非常多,我们也有相关教程参数,让大家都能轻松绘制出美观高级的网络韦恩图!详戳:
《如何绘制各种高颜值的网络韦恩图?》
好啦,各式网络图,尽在OmicShare,快来实操体验吧!
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